人類細胞通常包含兩個拷貝的腫瘤抑制基因，后者通過減慢細胞分裂和生長來抑制腫瘤的形成。當這些基因被刪除——例如基因突變——就會導致癌癥的發(fā)生。

一般來說，要形成腫瘤，腫瘤抑制基因的兩個拷貝都必須在細胞中出現(xiàn)故障。然而，要識別這些雙基因異常是具有挑戰(zhàn)性的。其中一個問題在于，腫瘤通常含有不同比例的健康和癌變細胞，這使得難以確定癌細胞中是否有一兩個腫瘤抑制基因缺失。

這一次，F(xiàn)rancis Crick研究所的科學家建立了一個統(tǒng)計模型——利用單核苷酸多態(tài)性分析——來幫助克服上述問題。到目前為止，已經(jīng)識別出一系列新的腫瘤抑制基因。

27個新基因被發(fā)現(xiàn)

研究人員使用模型評估了12種癌癥中2218例腫瘤樣本中腫瘤抑制基因的數(shù)量。這些疾病包括乳腺癌、肺癌、結(jié)腸直腸癌、卵巢癌和腦癌。

該模型不僅使研究小組能夠計算每個腫瘤中健康和癌細胞的相對比例，確定腫瘤抑制基因在細胞中的存在更容易，同時也揭示了腫瘤抑制基因獨特的“DNA足跡”。這使他們能夠?qū)⑦@些基因與非有害的基因突變區(qū)別開來。

最終，研究人員在腫瘤中發(fā)現(xiàn)了96個基因缺失。其中包括43個腫瘤抑制基因，其中27個是此前未知的。

資深作者Peter Van Loo解釋道：“我們的研究表明，這種罕見的腫瘤抑制基因可以通過對癌癥樣本中基因拷貝數(shù)的大規(guī)模分析來識別。”他還補充說：“癌癥基因組學是一個不斷增長的研究領域，我們使用的計算工具是發(fā)現(xiàn)癌癥相關基因的有力手段。”

為個性化治療提供動力

癌癥仍然是世界上最大的健康負擔之一。2012年，全球大約有1410萬新確診的癌癥病例，其中肺癌、乳腺癌和結(jié)直腸癌是最常見的。在美國，去年有160多萬新的癌癥病例被確診，超過595,000人死于癌癥。

研究人員認為，這項發(fā)現(xiàn)可能會促進個性化癌癥治療——也就是根據(jù)腫瘤的基因組成對個體病人進行量身定制的治療。“使用這種強大的工具包，我們發(fā)現(xiàn)了罕見的腫瘤抑制基因，當它們在變異細胞中丟失時，就會導致癌癥。這可能為發(fā)展個性化的癌癥治療鋪平道路。”

參考資料：

Pan-cancer analysis of homozygous deletions in primary tumours uncovers rare tumour suppressors

Scientists discover 27 genes that could halt cancer