通過檢測血液或尿液中少量的RNA來診斷或治療疾病是一個新興領(lǐng)域。隨著技術(shù)的進步，研究人員可以對RNA片段進行測序，但不同的人使用不同的方法來測序RNA，有時會得到不同的結(jié)果，這是影響成功的一個重大障礙，使得此領(lǐng)域很難取得進展。近來，密歇根大學(xué)Tewari教授的實驗室領(lǐng)導(dǎo)了美國和荷蘭的9個實驗室組成聯(lián)盟，通過美國國立衛(wèi)生研究院，試圖解決這個問題。該聯(lián)盟測試了9種不同的RNA測序方法，以了解和標(biāo)準(zhǔn)化測序小RNA的最佳方法，他們的目標(biāo)是創(chuàng)建一個可以從一個實驗室復(fù)制到另一個實驗室的標(biāo)準(zhǔn)。

基于RNA的液體活檢主要依賴于對小RNA測序的能力，例如microRNA。這些微小的細胞碎片可以在癌癥等疾病中發(fā)生改變，為早期發(fā)現(xiàn)疾病提供線索。但是，血液或尿液只含有少量的細胞外RNA，這使得測序變得更具挑戰(zhàn)性。

Tewari教授說：“RNA液體活檢是一個令人興奮的診斷新領(lǐng)域。因為不同的方法可能會帶來不同的結(jié)果，所以這個領(lǐng)域需要一個聯(lián)盟。”他還指出，這項工作的優(yōu)勢在于將不同的專業(yè)知識匯集在一起，從分子生物學(xué)家到生物信息學(xué)專家。

7月16日，這項在《Nature Biotechnology》雜志上發(fā)表的題為“Comprehensive multi-center assessment of accuracy, reproducibility and bias of small RNA-seq methods for quantitative miRNA profilin”的研究中，科學(xué)家們對樣本進行了相同的準(zhǔn)備，并將其送往全球的9個實驗室進行分析。每個實驗室使用9種不同的測試方法對四個不同的樣本（一個血漿樣本和三個合成RNA樣本）進行測序。最終，他們共獲得超50億的測序結(jié)果。

“我們發(fā)現(xiàn)，不僅不同的方法產(chǎn)生不同的結(jié)果，而且在同一測序方法中，任何微小的變化都會帶來一個顯著的變化。該研究的主要作者、Tewari實驗室的博士后研究員Maria D. Giraldez說：“為了比較各實驗室結(jié)果之間的差異，我們需要一套通用、高度標(biāo)準(zhǔn)化的方法指南。”

該研究的作者、Tewari實驗室的Ryan Spengler博士后研究員說：“如果你在多個實驗室使用相同的方法，結(jié)果就不會有太大的變化。”“這意味著，如果你想在不同的實驗室之間協(xié)調(diào)一項研究，關(guān)鍵是要遵守同樣的方法。”

由聯(lián)盟實驗室開發(fā)的方法提高了液體活檢的準(zhǔn)確性。當(dāng)用RNA測序來比較不同樣本之間個體microRNA的相對數(shù)量時，所有的方法都產(chǎn)生了準(zhǔn)確和可重復(fù)的估計。該研究為創(chuàng)建標(biāo)準(zhǔn)程序的方法奠定了基礎(chǔ)，并推動RNA測序和液體活檢領(lǐng)域的進步。

研究人員已經(jīng)制作出了綜合參考材料，這意味著全國的研究人員都可以按照他們的方法進行測試，并將結(jié)果與實驗室聯(lián)盟發(fā)現(xiàn)的結(jié)果進行比較。Tewari的實驗室正在繼續(xù)致力于改進方法，以便更有效地發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)記物。

參考資料：

1）Overcoming a major barrier to developing liquid biopsies

2）Comprehensive multi-center assessment of accuracy, reproducibility and bias of small RNA-seq methods for quantitative miRNA profiling, Nature Biotechnology (2018). DOI: 10.1038/Nbt.4183, https://www.nature.com/articles/Nbt.4183

原標(biāo)題：液體活檢新突破！科學(xué)家們開發(fā)出“RNA測序”的通用模板