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plos one:脊髓肌萎縮與單倍體型之間的關(guān)系

來(lái)源:生物谷   2018年09月07日 14:26 手機(jī)看

一項(xiàng)關(guān)于自然史的研究提供了關(guān)于脊髓性肌萎縮癥(SMA)發(fā)展的首個(gè)臨床綜述,并將祖先染色體5單倍型和SMN2拷貝數(shù)與疾病嚴(yán)重程度聯(lián)系起來(lái)。 SMA是一種破壞性遺傳疾病,影響機(jī)體控制、運(yùn)動(dòng),進(jìn)食和呼吸的運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元。SMA是全世界嬰兒死亡的主要遺傳原因,全世界新生兒發(fā)病率約為1/10,000,而Mennonite血統(tǒng)嬰兒中發(fā)病率則高達(dá)1/2800。這項(xiàng)觀察在群體特異性框架內(nèi)進(jìn)行,以闡明疾病表達(dá)的細(xì)微差異以及隨后在生命早期使用的療法的影響。賓夕法尼亞州斯特拉斯堡的特殊兒童臨床醫(yī)生和研究人員將42名Mennonit族群和14名Amish族群SMA患者納入研究。該研究今天在PLOS ONE上在線發(fā)表。

DNA微衛(wèi)星和260萬(wàn)標(biāo)記單核苷酸多態(tài)性(SNP)微陣列用于檢查單倍型的遺傳組成,這一方法揭示了不同患者組之間的結(jié)構(gòu)相似性。Mennonit SMA單倍型(M1a,M2)分別包括1和2個(gè)SMN2的拷貝,并且單個(gè)Amish SMA單倍型(A1)具有1個(gè)SMN2拷貝。 M1a / M1a,M1a / M2和M2 / M2是突出的SMA基因型。

該研究揭示了作為SMN2拷貝數(shù)和SMA單倍型的函數(shù)的運(yùn)動(dòng)神經(jīng)病變的時(shí)間和嚴(yán)重性的重要差異。具有兩個(gè)SMN2拷貝的基因型與早期疾病發(fā)作、運(yùn)動(dòng)發(fā)育受限有關(guān)。然而,更令人驚訝的發(fā)現(xiàn)是,與M1 / M1單倍型相比,具有A1 / A1的個(gè)體之間臨床嚴(yán)重性和存活率的差異,其傳遞相同數(shù)量的SMN2拷貝。研究人員計(jì)劃使用整個(gè)外顯子組序列數(shù)據(jù)以更高的分辨率比較A1和M1a,以便解釋這些差異。

資訊出處:Researchers correlate spinal muscular atrophy disease expression with haplotypes

原始出處:Vincent J. Carson et al, Spinal muscular atrophy within Amish and Mennonite populations: Ancestral haplotypes and natural history, PLOS ONE (2018). DOI: 10.1371/journal.pone.0202104

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