使用反義寡聚核苷酸(antisense oligonucleotide)作為療法的概念早在1978年就被提出,對RNA干擾(RNA interference, RNAi)的研究也在2006年獲得了諾貝爾獎(jiǎng)的認(rèn)可。但是,RNA療法的研發(fā)卻并不是一帆風(fēng)順。直到最近兩年,Ionis Pharmaceuticals的反義寡核苷酸療法(ASO)Spinraza(nusinersen)和Tegesedi(inotersen),以及Alnylam Pharmaceuticals的siRNA療法Onpattro(patisiran)才相繼獲得FDA的批準(zhǔn)。這些創(chuàng)新療法的批準(zhǔn)意味著RNA療法的技術(shù)平臺正在走向成熟。在今天這篇文章里,藥明康德的微信團(tuán)隊(duì)將向讀者們介紹RNA療法的現(xiàn)狀以及產(chǎn)業(yè)發(fā)展?fàn)顩r。
RNA療法的兩大類型:ASO和siRNA
RNA療法的機(jī)理是使用能夠與mRNA通過堿基配對結(jié)合的寡核苷酸來影響mRNA的代謝過程,這可能包括從mRNA前體(pre-mRNA)開始的mRNA剪接和成熟過程,mRNA的運(yùn)送,根據(jù)mRNA進(jìn)行的蛋白轉(zhuǎn)譯,以及mRNA的降解過程。目前RNA療法可以分為siRNA和ASO兩大類型。
siRNA和ASO的分子特性和化學(xué)修飾手段
siRNA療法注入患者體內(nèi)的是雙鏈寡核苷酸,其中的反義核苷酸鏈需要在體內(nèi)經(jīng)過處理與有義RNA鏈脫離后才能夠與特定mRNA片段相結(jié)合,Alnylam公司的Onpattro屬于這類療法。而ASO在注入患者體內(nèi)時(shí)就是單鏈寡核苷酸,它可以直接與靶點(diǎn)相結(jié)合。Ionis公司的Spinraza和Tegesedi都屬于這種療法。由于注入患者體內(nèi)時(shí)的形態(tài)不同,siRNA和ASO藥物也有不同的分子屬性,需要不同的化學(xué)修飾來提高它們的穩(wěn)定性和被組織和細(xì)胞吸收的能力。
雙鏈和單鏈寡核苷酸的分子特性及常見修飾方法(圖片來源:參考資料[1])
雙鏈寡核苷酸的親水性強(qiáng),如果沒有經(jīng)過修飾的話,在組織中擴(kuò)散和被細(xì)胞吸收的效果都不是很好。因此對它們的修飾和處理包括使用脂質(zhì)納米顆粒幫助將雙鏈寡核苷酸運(yùn)送到靶點(diǎn)組織并且保護(hù)核苷酸不被降解。另外的一種修飾方法使用N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)修飾來促進(jìn)siRNA被肝細(xì)胞的靶向吸收,這種方法對雙鏈和單鏈寡核苷酸都有效。
單鏈寡核苷酸本身的親水性比雙鏈寡核苷酸弱,通過硫代修飾(phosphorothioate modification)可以提高它們的穩(wěn)定性,增強(qiáng)在組織中的擴(kuò)散和被細(xì)胞吸收的能力。
除了這些最基本的化學(xué)修飾和處理方法,新一代的修飾手段在提高寡核苷酸的穩(wěn)定性的同時(shí),能夠?qū)⑺鼈兣c各種靶向特定組織或細(xì)胞的蛋白連接在一起,從而提高定向運(yùn)送寡核苷酸的能力。
RNA療法對基因表達(dá)的調(diào)控方式
不管使用siRNA還是ASO,它們與靶點(diǎn)RNA序列結(jié)合后可以通過一系列手段調(diào)節(jié)基因表達(dá)水平。最常見的作用機(jī)制是利用RNase H1或者RISC復(fù)合體對形成的雙鏈RNA復(fù)合體進(jìn)行降解,從而降低基因表達(dá)。Alnylam公司的Onpattro和Ionis公司的Tegesedi都是使用這一機(jī)理降解編碼TTR蛋白的mRNA,從而達(dá)到治療hATTR患者的效果。
而另一大類調(diào)控基因表達(dá)的作用方式不需要對雙鏈RNA復(fù)合體進(jìn)行降解,這些機(jī)制包括:通過與mRNA剪接位點(diǎn)的結(jié)合,抑制或增強(qiáng)特定RNA剪接的發(fā)生。Ionis公司治療脊髓性肌肉萎縮癥(SMA)的Spinraza就是使用這種作用機(jī)理增強(qiáng)SMN蛋白的表達(dá)。除了影響剪接過程以外,單鏈ASO還可以通過與mRNA的特定位點(diǎn)結(jié)合,抑制或增強(qiáng)蛋白轉(zhuǎn)錄。這些潛在作用機(jī)制增強(qiáng)了RNA療法在臨床應(yīng)用上的潛力。讓它們不但可以用于減少蛋白的表達(dá),還可以用于增強(qiáng)蛋白的表達(dá)。
RNA藥物調(diào)節(jié)基因表達(dá)的潛在機(jī)制:A,RNase H介導(dǎo)的mRNA降解;B,RISC介導(dǎo)的mRNA降解;C,調(diào)節(jié)mRNA的剪接;D,抑制或增強(qiáng)mRNA的轉(zhuǎn)譯;E,與微RNA競爭(圖片來源:參考資料[1])
RNA療法公司一覽
提到RNA療法的公司,我們最先想到的可能是兩個(gè)名字,Ionis和Alnylam。確實(shí),這兩家公司的RNA療法近兩年來相繼獲得FDA批準(zhǔn)上市,在研發(fā)ASO和siRNA療法方面也具有豐富的經(jīng)驗(yàn)。不過除了這兩家公司以外,其它的RNA療法公司也在努力進(jìn)行ASO或siRNA產(chǎn)品的臨床研發(fā)。下面我們來看一看這一領(lǐng)域的一些重要公司。
Ionis Pharmaceuticals (Akcea Therapeutics)
Ionis和它的子公司Akcea在研發(fā)ASO療法領(lǐng)域可以說是領(lǐng)頭羊之一。該公司的Spinraza在治療SMA患者方面療效非常顯著,而治療hATTR的Tegesedi最近也獲得了FDA的批準(zhǔn)。如今,該公司與百?。˙iogen)、羅氏(Roche)、阿斯利康(AstraZeneca)、諾華(Novartis)、楊森(Janssen)和葛蘭素史克(GSK)等多年大型醫(yī)藥公司都有合作項(xiàng)目。研發(fā)的ASO療法靶向的疾病領(lǐng)域包括神經(jīng)疾病,罕見病,心血管與腎臟疾病和癌癥等領(lǐng)域。
Alnylam Pharmaceuticals
與Ionis在研發(fā)ASO療法領(lǐng)域的地位相似,Alnylam公司在研發(fā)siRNA療法方面也處于領(lǐng)先地位。除了剛剛獲得批準(zhǔn)的Onpattro以外,該公司還有多項(xiàng)siRNA產(chǎn)品已經(jīng)進(jìn)入3期臨床試驗(yàn)階段。其中,治療高膽固醇血癥的inclisiran通過降低PCSK9水平能夠顯著降低患者的LDL-C水平。靶向抗凝血酶(antithrombin)的fitusiran可用于治療血友病和罕見出血疾病。而靶向氨基乙酰丙酸合成酶1(ALAS1)的givosiran在治療急性肝卟啉癥(AHPs)的3期臨床試驗(yàn)中也表現(xiàn)出良好的療效。該公司目前的研發(fā)重點(diǎn)方向包括遺傳病,心血管和代謝類疾病,肝炎和中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病。
Alnylam公司藥物研發(fā)管線(圖片來源:Alnylam公司官網(wǎng))
Arrowhead Pharmaceuticals
Arrowhead Pharmaceuticals近日的重大新聞是與強(qiáng)生公司旗下的楊森(Janssen)公司簽署了高達(dá)37億美元的合作協(xié)議,將該公司的主打siRNA產(chǎn)品,治療乙肝的ARO-HBV的研發(fā)許可授予楊森公司。Arrowhead的主要研發(fā)方向是采用siRNA療法治療因?yàn)檫z傳因素導(dǎo)致蛋白過度表達(dá)的疾病。除了ARO-HBV以外,該公司治療罕見遺傳病α-1抗胰蛋白酶缺乏癥(AATD)的ARO-ATT也已經(jīng)進(jìn)入1期臨床試驗(yàn)。除了與楊森公司的合作以外,該公司還與安進(jìn)(Amgen)公司合作研發(fā)靶向心血管疾病靶點(diǎn)的療法。
Sarepta Therapeutics
Sarepta公司治療杜興氏肌營養(yǎng)不良癥患者(DMD)的Exondys 51(eteplirsen)已經(jīng)獲得FDA批準(zhǔn)。該公司的技術(shù)平臺使用二氨基磷酸酯嗎啉代寡聚物(PMOs)讓核糖體跳過發(fā)生突變的外顯子,從而產(chǎn)生能夠緩解DMD患者功能缺陷的抗肌萎縮蛋白。該公司的PMO技術(shù)平臺使用嗎啉(morpholine)代替RNA中的核糖(ribose),這一置換在保持PMO能夠與特定RNA序列正常結(jié)合的同時(shí),提高了PMO的穩(wěn)定性。目前,該公司有多項(xiàng)治療DMD的PMO療法在3期臨床試驗(yàn)中接受檢驗(yàn),用于治療在編碼肌萎縮蛋白的DMD基因不同外顯子上發(fā)生變異的患者。
PMO與RNA的結(jié)構(gòu)區(qū)別(圖片來源:Sarepta公司官網(wǎng))
Quark Pharmaceuticals
Quark公司靶向p53基因的siRNA療法QPI-1002已經(jīng)進(jìn)入3期臨床試驗(yàn),用于防止和緩解移植腎功能延遲恢復(fù)(DGF)。在治療眼科疾病方面,靶向胱天蛋白酶2(caspase 2)的QPI-1007也已經(jīng)開始3期臨床試驗(yàn)。Quark公司同時(shí)與諾華和輝瑞(Pfizer)公司達(dá)成研發(fā)協(xié)議,分別研發(fā)靶向p53基因和靶向RTP801基因的siRNA療法。
Quark公司進(jìn)入2-3期臨床試驗(yàn)的在研項(xiàng)目(圖片來源:Quark公司官網(wǎng))
這一領(lǐng)域還有其它的生物技術(shù)公司在開發(fā)ASO或siRNA療法,例如Antisense Therapeutics,Wave Life Sciences,Benitec Biopharma等等。其中Wave Life Sciences與武田(Takeda)和輝瑞公司都達(dá)成了合作協(xié)議。而Benitec公司也與Axovant Sciences達(dá)成研發(fā)協(xié)議治療神經(jīng)疾病。
結(jié)語
隨著RNA療法技術(shù)的日趨成熟,大型醫(yī)藥公司對這一領(lǐng)域的投入也日漸增多,除了上面提到過的多項(xiàng)合作以外,賽諾菲(Sanofi)和再生元(Regeneron)與Alnylam公司也達(dá)成了研發(fā)合作協(xié)議。據(jù)統(tǒng)計(jì),目前有20多個(gè)ASO療法在2-3期臨床試驗(yàn)中接受檢驗(yàn),而在siRNA療法方面,也有十多個(gè)2-3期臨床項(xiàng)目正在進(jìn)行中。因此,在未來數(shù)年,我們可能看到更多RNA療法獲得批準(zhǔn)上市。
誠然,在開發(fā)RNA療法的道路上仍然有需要面對的挑戰(zhàn),作為一種新的治療模式,這類療法在接受監(jiān)管機(jī)構(gòu)審查時(shí)面對更多的不確定性。近日Ionis公司治療家族性乳糜微粒血癥綜合征(FCS)的Waylivra(volanesorsen)在獲得獨(dú)立咨詢委員會(huì)正面意見后仍然未能獲得FDA批準(zhǔn)就是一個(gè)很好的例子。將靶向RNA的藥物運(yùn)送到靶點(diǎn)器官的同時(shí)防止嚴(yán)重副作用的產(chǎn)生仍然是這一領(lǐng)域需要解決的挑戰(zhàn)。不過我們相信隨著科學(xué)研究和臨床研發(fā)的進(jìn)一步發(fā)展,這一類型的療法有望繼小分子和生物制劑之后,成為一種主流的治療模式。
參考資料:
[1] Crooke et al., (2018). RNA-Targeted Therapeutics. Cell Metabolism, https://doi.org/10.1016/j.cmet.2018.03.004
[2] Ionis Pharmaceuticals. Retrieved October 25, 2018, from http://www.ionispharma.com/
[3] Alnylam Pharmaceuticals, Retrieved October 25, 2018, from http://www.alnylam.com/
[4] Arrowhead Pharmaceuticals, Retrieved October 25, 2018, from https://arrowheadpharma.com/
[5] Sarepta Therapeutics, Retrieved October 25, 2018, from https://www.sarepta.com/technology/rna-biology-sarepta-therapeutics
[6] Quark Pharmaceuticals, Retrieved October 25, 2018, from http://quarkpharma.com/
[7] RNA-interference (RNAi) Market expected to witness the fastest growth during the forecast period. Retrieved October 25, 2018, from https://ourmarketresearch.com/183361/rna-interference-rnai-market-expected-to-witness-the-fastest-growth-during-the-forecast-period/
[8] Pfizer Selects Final Two Targets in Hepatic Disease Partnership with Wave Life Sciences. Retrieved October 25, 2018, from https://www.genengnews.com/gen-news-highlights/pfizer-selects-final-two-targets-in-hepatic-disease-partnership-with-wave-life-sciences/81255792
[9] Benitec Biopharma secures multimillion-dollar licensing deal with Axovant Sciences. Retrieved October 25, 2018, from https://smallcaps.com.au/benitec-biopharma-secures-licensing-deal-axovant-sciences/
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