最近發(fā)表在Nature Genetics上的最全面的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)結(jié)果發(fā)現(xiàn)了40種新的與結(jié)腸癌的風險增加有關(guān)的遺傳變異。
由Fred Hutchinson癌癥研究中心的一個研究小組領(lǐng)導(dǎo)的這項研究同時確定了第一種罕見的散發(fā)性結(jié)直腸癌保種??傊@些發(fā)現(xiàn)對于創(chuàng)建個性化篩查策略和更好地為結(jié)直腸癌的藥物開發(fā)提供了重要的信息。
這些研究結(jié)果也闡明了研究作者在藥物開發(fā)中所謂的“錯失機會”。作者認為,使用GWAS結(jié)果為癌癥藥物開發(fā)提供信息可以提高藥物開發(fā)成功率,甚至可以為高風險人群提供化學預(yù)防藥物。
(Wikipedia/CC BY-SA 3.0)
“使用GWAS結(jié)果為抗癌藥物的靶點發(fā)現(xiàn)提供了很大的潛力。對于2型糖尿病和心臟病等疾病,GWAS方法推動了新生物學和潛在藥物靶點的發(fā)現(xiàn),”該研究的作者,Jeroen Huyghe博士解釋說:“迄今為止,對癌癥治療新目標的研究主要集中在癌癥細胞的分子特征上。我們認為使用GWAS方法為結(jié)直腸癌的藥物開發(fā)提供了一個巨大的機會。”
Huyghe解釋說:“大規(guī)模的全基因組測序研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)百種尚未系統(tǒng)檢查與疾病相關(guān)的遺傳變異。我們的研究充分利用了Haplotype Reference Consortium面板的可用性,該面板是來自超過32,000個個體的序列數(shù)據(jù)的群體參考面板。通過將該策略與定制設(shè)計的基因分型芯片相結(jié)合,我們能夠穩(wěn)健地識別罕見的變異關(guān)聯(lián)信號以及涉及低頻變種的多個附加信號。“
之前針對結(jié)直腸癌風險的GWAS僅考察了常見的遺傳變異。相比之下,這項研究涉及超過2,000個人的全基因組測序,旨在檢查罕見遺傳變異對結(jié)直腸癌風險的貢獻。
“通過這項研究,我們已經(jīng)將已知數(shù)量的結(jié)直腸癌風險變種帶到了近100個,”該研究的共同第一作者,F(xiàn)red Hutch的遺傳流行病學家Tabitha Harrison說。 “接下來,我們將研究人群擴大到包括來自不同種族背景的人。這將使我們更全面地了解整個人口的風險。”
資訊出處:Study discovers 40 new genetic variants associated with colorectal cancer risk
原始出處:Jeroen R. Huyghe et al, Discovery of common and rare genetic risk variants for colorectal cancer, Nature Genetics (2018). DOI: 10.1038/s41588-018-0286-6
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