正常組織隨著年齡的增長而累積遺傳變化,但是在慢性退行性疾病的情況下,體細胞突變是否促進非惡性細胞的克隆擴增(clonal expansion)尚不清楚。
在一項新的研究中,來自美國國家糖尿病、消化與腎疾病研究所和德克薩斯大學西南醫(yī)學中心的研究人員通過對來自82名患者的患病肝臟樣本進行外顯子組測序,揭示出肝硬化中的復雜突變景觀。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2019年4月18日的Cell期刊上,論文標題為“Somatic Mutations Increase Hepatic Clonal Fitness and Regeneration in Chronic Liver Disease”。
圖片來自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.03.026。
進一步的超深度測序鑒定出PKD1、PPARGC1B、KMT2D和ARID1A基因發(fā)生頻發(fā)突變(recurrent mutation)。細胞突變體克隆的數(shù)量和大小隨著肝臟纖維化階段和組織損傷的增加而增加。
為了研究突變基因的功能影響,這些研究人員建立了一種合并的體內(nèi)CRISPR篩選方法。與測序結(jié)果一致的是,對147個基因的檢測再次表明Pkd1、Kmt2d和Arid1a的缺失促進了克隆擴增。在小鼠中,這些基因的條件性雜合缺失在組織損傷檢測中也具有保肝作用。癌變前的體細胞突變通常從癌癥的視角來觀察,但是他們證實突變能夠促進肝臟組織再生,而可能與癌癥發(fā)生無關(guān)。
參考資料:Min Zhu et al. Somatic Mutations Increase Hepatic Clonal Fitness and Regeneration in Chronic Liver Disease. Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2019.03.026.
原標題:Cell:揭示體細胞突變促進肝臟組織再生
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