一個(gè)由科學(xué)家組成的國(guó)際聯(lián)盟分析了近4.6萬(wàn)人的蛋白質(zhì)編碼基因,發(fā)現(xiàn)罕見(jiàn)的DNA改變與2型糖尿病有關(guān)。該研究是同類(lèi)研究中已知規(guī)模最大的研究之一,包括來(lái)自歐洲、非洲裔美國(guó)人、拉美裔/拉丁裔、東亞和南亞祖先的數(shù)據(jù)。
從這個(gè)龐大的群體--大約21,000名2型糖尿病患者和25,000名健康對(duì)照參與者--中,研究人員確定了四個(gè)可以影響糖尿病風(fēng)險(xiǎn)的罕見(jiàn)變異基因。這些數(shù)據(jù)表明,未來(lái)可能還會(huì)發(fā)現(xiàn)數(shù)百個(gè)基因。
這些基因和它們所編碼的蛋白質(zhì)是新藥的潛在目標(biāo),并可能指導(dǎo)研究人員更好地理解和治療糖尿病。
圖片來(lái)源:Nature
該小組的所有結(jié)果都可以通過(guò)2型糖尿病知識(shí)門(mén)戶(hù)網(wǎng)站(Type 2 Diabetes Knowledge Portal)獲得,這使世界各地的科學(xué)家能夠訪問(wèn)和使用這些信息進(jìn)行自己的研究。
密歇根大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院生物統(tǒng)計(jì)學(xué)教授、統(tǒng)計(jì)遺傳學(xué)中心主任、資深研究作者M(jìn)ichael Boehnke說(shuō):"這些結(jié)果表明了研究來(lái)自不同祖先的大量個(gè)體樣本的重要性。大多數(shù)大型人口研究關(guān)注的都是歐洲血統(tǒng)的個(gè)體,這使得很難在全球范圍內(nèi)推廣研究結(jié)果。群體越多樣化,科學(xué)性就越高,信息也就越多。"
這項(xiàng)研究的第一作者Jason Flannick說(shuō):"我們現(xiàn)在對(duì)罕見(jiàn)的DNA變異在糖尿病中的作用有了更新的認(rèn)識(shí)。這些罕見(jiàn)的變異可能為藥物開(kāi)發(fā)提供比以前認(rèn)為的更有價(jià)值的資源。事實(shí)上,我們可以在許多基因中發(fā)現(xiàn)它們與疾病相關(guān)的證據(jù),這些基因可以作為新藥的靶點(diǎn),也可以用來(lái)研究疾病的基本過(guò)程。"Flannick是哈佛醫(yī)學(xué)院(Harvard Medical School)兒科學(xué)助理教授,波士頓兒童醫(yī)院(Boston Children's Hospital)遺傳學(xué)和基因組學(xué)部門(mén)的教授,也是麻省理工學(xué)院(MIT)和哈佛大學(xué)布羅德研究所(Broad Institute of Harvard)的副研究員。
其他資深作者還包括牛津大學(xué)(University of Oxford)糖尿病醫(yī)學(xué)教授Mark McCarthy,以及麻省總醫(yī)院內(nèi)分泌科和糖尿病科主任、哈佛醫(yī)學(xué)院(Harvard Medical School)醫(yī)學(xué)教授、布羅德研究所(Broad Institute)糖尿病研究組主任Jose Florez。這項(xiàng)研究于近日發(fā)表在《Nature》上。
全球關(guān)注的問(wèn)題
據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計(jì),全世界有4億多人患有糖尿病。這些病例中絕大多數(shù)是2型糖尿病患者。據(jù)估計(jì),糖尿病是全球第七大致死原因。雖然研究人員已經(jīng)知道生活方式和環(huán)境因素在2型糖尿病中扮演著重要角色,但有必要對(duì)驅(qū)動(dòng)這種疾病的生物學(xué)機(jī)制有更深入的了解。
在這項(xiàng)研究中,研究人員對(duì)所謂的"外顯子"(exome)進(jìn)行了測(cè)序,也就是說(shuō),只對(duì)基因組中編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域進(jìn)行測(cè)序。
另一種尋找疾病相關(guān)變異的方法是基因組廣泛關(guān)聯(lián)研究(GWAS)。這種方法可以非常有效地在整個(gè)基因組中發(fā)現(xiàn)常見(jiàn)的疾病變異,但可能會(huì)漏掉不太常見(jiàn)的外顯子組變異。這是關(guān)鍵,因?yàn)楸M管罕見(jiàn)的外顯子組變異極其難以檢測(cè),但它們可以提供對(duì)疾病相關(guān)基因的寶貴知識(shí),進(jìn)而可以提出新的藥物靶點(diǎn)。
因此,研究人員打算在未來(lái)的研究中增加樣本量。這可能是對(duì)2型糖尿病進(jìn)行的最大的外顯子組測(cè)序研究,其隊(duì)列人數(shù)接近5萬(wàn)人,但正如作者在論文中所述,即使是那些影響最大的罕見(jiàn)變異,也可能需要7.5萬(wàn)至18.5萬(wàn)例樣本。
Jose Florez說(shuō):"重要的是要記住僅僅因?yàn)槲覀冊(cè)跈z測(cè)蛋白質(zhì)編碼DNA的變異,我們就無(wú)法在檢測(cè)出顯著影響所需的樣本數(shù)量上有所突破。這些變化的影響可能是強(qiáng)大的,但因?yàn)樗鼈兪侨绱撕币?jiàn),我們?nèi)匀恍枰黾訕颖玖?,以便真正得出令人信服的?jiàn)解。"
參考資料:
Jason Flannick et al. Exome sequencing of 20,791 cases of type 2 diabetes and 24,440 controls, Nature (2019). DOI: 10.1038/s41586-019-1231-2
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