對脫落到患者血液循環(huán)中的腫瘤DNA進(jìn)行分析可提供一種檢測腫瘤存在并分析它的DNA是否發(fā)生可靶向突變的非侵入性方法。對循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）進(jìn)行縱向分析有望監(jiān)測治療反應(yīng)。

不幸的是，檢測血液中少量腫瘤DNA是較為困難的，特別是在已接受初始化療的非轉(zhuǎn)移性癌癥患者中。在這些患者中，在治療期間或在治療完成之后，當(dāng)前的大多數(shù)方法對殘留疾病的檢測缺乏足夠的靈敏度。

在一項(xiàng)新的研究中，為了解決這個(gè)問題和改進(jìn)對血漿中微量殘留腫瘤DNA的檢測靈敏度，來自美國亞利桑那州菲尼克斯市轉(zhuǎn)化基因組學(xué)研究所、亞利桑那州立大學(xué)、梅奧診所、希望之城和英國劍橋大學(xué)的研究人員開發(fā)出一種稱為靶向數(shù)字測序（targeted digital sequencing, TARDIS）的方法，用于多重分析患者特異性的癌癥突變。在參考樣本中，在使用相當(dāng)于單管血液的輸入DNA的情形下，通過同時(shí)分析8到16個(gè)已知突變，TARDIS在突變等位基因分?jǐn)?shù)（mutant allele fraction）為0.03%和0.003%時(shí)分別實(shí)現(xiàn)91%和53%的靈敏度，它的檢測特異性為96%。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2019年8月7日的Science Translational Medicine期刊上，論文標(biāo)題為“Personalized circulating tumor DNA analysis to detect residual disease after neoadjuvant therapy in breast cancer”。

在來自33名患有I期至III期乳腺癌的女性患者的80份血漿樣本中，這些研究人員成功地分析了每名患者多達(dá)115個(gè)突變。在治療前，TARDIS在所有患者中檢測到ctDNA（中位等位基因分?jǐn)?shù)為0.11％）。在完成新輔助療法后，與殘留疾病患者相比，實(shí)現(xiàn)病情完全緩解的患者的ctDNA濃度較低（中位等位基因分?jǐn)?shù)分別為0.003％和0.017％，P = 0.0057，AUC = 0.83）。此外，實(shí)現(xiàn)病情完全緩解的患者在新輔助治療期間表現(xiàn)出更大的ctDNA濃度下降。

這些結(jié)果證實(shí)了在新輔助治療期間，使用ctDNA分析評估分子反應(yīng)和殘留疾病的高準(zhǔn)確度。相比于當(dāng)前在使用臨床相關(guān)血容量的情形下達(dá)到的ctDNA檢測極限，TARDIS實(shí)現(xiàn)高達(dá)100倍的改進(jìn)，這就證實(shí)個(gè)性化ctDNA跟蹤可能能夠?qū)崿F(xiàn)對以治療為目的的癌癥患者進(jìn)行個(gè)體化臨床管理。

參考資料：

Bradon R. McDonald et al. Personalized circulating tumor DNA analysis to detect residual disease after neoadjuvant therapy in breast cancer. Science Translational Medicine, 2019, doi:10.1126/scitranslmed.aax7392.

原標(biāo)題：Science子刊：新型ctDNA血液測試可顯著改善乳腺癌診斷