全基因組關聯(lián)研究(Genome-wide association studies,GWASs)已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)百種人類癌癥的遺傳"風險"變異。絕大多數(shù)可能通過調(diào)控其他基因的表達而促進癌癥的發(fā)展,但這些靶基因在很大程度上仍未被探索。
Xingyi Guo博士、Zhishan Chen博士及其同事利用來自多個公共資源的基因表達數(shù)據(jù),系統(tǒng)地評估了294種GWAS相關變異,它們分別針對6種癌癥--結(jié)腸直腸癌、肺癌、卵巢癌、前列腺癌、胰腺癌和黑色素瘤。
圖片來源:American Journal of Human Genetics
他們確定了270個候選目標基因,其中99個基因有之前未報道的相關性。結(jié)合該小組之前的乳腺癌數(shù)據(jù),至少有兩種癌癥類型共有24個基因。 研究人員發(fā)現(xiàn),33個靶基因與特定的突變特征相關,66個與腫瘤組織的腫瘤突變負擔相關。
發(fā)表在《American Journal of Human Genetics》上的這一發(fā)現(xiàn),加深了人們對GWAS識別的風險變異可能如何促進致癌的理解:通過調(diào)節(jié)靶易感基因,進而促進體細胞基因突變的產(chǎn)生。
參考資料: Zhishan Chen et al. Identifying Putative Susceptibility Genes and Evaluating Their Associations with Somatic Mutations in Human Cancers, The American Journal of Human Genetics (2019). DOI: 10.1016/j.ajhg.2019.07.006
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