陰莖癌的確切病因尚不清楚。目前以包皮過長、包莖、包皮垢學說較為公認。包皮環(huán)切術(shù)，常與宗教有關(guān)，而陰莖癌有包莖而未行包皮環(huán)切術(shù)者可達25%～75%。在猶太民族中，新生兒即行包皮環(huán)切術(shù)，陰莖癌極罕見，伊斯蘭民族3～5歲行包皮環(huán)切術(shù)，其陰莖癌發(fā)病率明顯低于未行包皮環(huán)切術(shù)的人群。在美國，陰莖癌發(fā)病率為1/10萬，未行包皮環(huán)切術(shù)陰莖癌發(fā)生的風險為1/600。細菌產(chǎn)物包皮垢長期刺激包皮和陰莖頭是陰莖癌發(fā)生的最重要的原因。一般統(tǒng)計成年以后行包皮環(huán)切術(shù)不能預防陰莖癌的發(fā)生，因為已受到包皮垢的長期刺激。迄今尚未找到包皮垢是致癌物質(zhì)的確切根據(jù)。有實驗證實，將馬的包皮垢接種于小鼠皮下而致皮膚癌;人的包皮垢涂于小鼠宮頸及陰道壁，可誘發(fā)鼠的宮頸癌，但也有未能誘發(fā)成癌的報道。
陰莖癌可能與病毒感染有關(guān)。單純皰疹病毒(hsv)ⅱ型可能是陰莖癌和宮頸癌的致癌質(zhì)，有關(guān)資料表明，陰莖癌的性伴侶中，宮頸癌的發(fā)病率高于正常組3～8倍。人乳頭狀病毒(hpv)為雙絲dna病毒可感染各器官上皮。特殊類型的hpv可伴有男、女肛門生殖器疣和癌。陰莖癌中，hpvl6占0～49%，hpvl8占9%～39%，hpv6和hpvll不常見。巴西一組18例陰莖癌有7例存在hpvl8dna序列。
銀屑病口服光敏劑8-methoxypsoralen(甲基掃若論)和紫外線照射，可以增加陰莖癌的發(fā)病率。陰莖創(chuàng)傷或包皮環(huán)切術(shù)后皮膚瘢痕形成，腎移植患者免疫抑制劑的應用，可能與陰莖癌發(fā)生有關(guān)。
此外，許多癌前病變可惡化為陰莖癌，如陰莖白斑、干性陰莖頭炎、陰莖皮角，病毒性皮膚病(尖銳濕疣、巨大尖銳濕疣)。而增生性紅斑(或稱凱臘增生性紅斑)，鮑文細胞丘疹為陰莖的原位癌病變。（實習編輯：小雨）
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