據(jù)丹麥學(xué)者報(bào)道,結(jié)直腸癌(crc)基因及其表達(dá)序列標(biāo)記(est)的改變成為防治crc的最新靶點(diǎn)。
丹麥aarhus大學(xué)分子診斷學(xué)實(shí)驗(yàn)室的karin birkenkamp-demtroder博士指出,定義新的生物學(xué)標(biāo)志物和治療目的時(shí),需要了解結(jié)直腸癌(crc)的分子改變。為此,研究人員利用寡核苷酸芯片,監(jiān)測(cè)左側(cè)散發(fā)結(jié)直腸癌的全部rna的5個(gè)池(每個(gè)池含4至6個(gè)樣本)中的6,800個(gè)已知基因和35,000個(gè)表達(dá)序列標(biāo)記(est)的基因表達(dá)。
研究人員比較了正常組織和duke分期a-d期(無(wú)浸潤(rùn)至遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)移)的腫瘤組織,并識(shí)別了由正常發(fā)展至腫瘤組織時(shí)變化顯著的908個(gè)已知基因和4,155個(gè)est。結(jié)果發(fā)現(xiàn),通過(guò)強(qiáng)化濾除,226個(gè)已知基因和157個(gè)est與crc高度相關(guān)。
對(duì)25個(gè)單獨(dú)樣本進(jìn)行陣列分析發(fā)現(xiàn),>70%的病例證實(shí)了已知基因的變化。雙向分層平均連接簇分析分別將duke a期與正常組織集簇、duke b期與duke c期集簇、duke d期集簇。10個(gè)已知基因和5個(gè)est的實(shí)時(shí)pcr顯示,基于陣列的發(fā)現(xiàn)具有良好的重復(fù)性。改變頻率最高的基因位于代謝(22%)、轉(zhuǎn)錄與翻譯(11%)和細(xì)胞處理(9%)功能區(qū)。crc時(shí),15個(gè)核編碼的線粒體蛋白全部發(fā)生降調(diào)節(jié)。
研究人員識(shí)別了具有可能癌基因或腫瘤抑制基因簇的多個(gè)染色體區(qū)域。其中一些,例如15q25染色體上的氨肽酶n/cd13和sigma b3蛋白,與頻發(fā)雜合子丟失相一致。
birkenkamp-demtroder博士認(rèn)為,該研究發(fā)現(xiàn)的基因和est能夠編碼新的可能腫瘤標(biāo)志物,并可成為防治crc的新治療目標(biāo)。(實(shí)習(xí)編輯:李雪)
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