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核小體或會抑制CRISPR-Cas9的切割效率

來源:生物谷   2018年09月20日 16:07 手機看

近日,一項刊登在國際雜志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究報告中,來自猶他大學(xué)的科學(xué)家們通過研究發(fā)現(xiàn),核小體會抑制CRISPR/Cas9的切割效率,文章中,研究人員描述了如何在酵母樣本中檢測相關(guān)的基因編輯技術(shù)以及他們的研究發(fā)現(xiàn)。

圖片來源: Janet Iwasa (University of Utah, Salt Lake City)

“基因魔剪”CRISPR/Cas9能夠利用導(dǎo)向RNA來尋找并且切割DNA片段,但當(dāng)靶向片段是核小體的一部分會發(fā)生什么呢?此前研究人員通過研究發(fā)現(xiàn),在這種情況下,似乎CRISPR/Cas9的切割效率會被降低;這項研究中,研究人員通過對這種情況進行體內(nèi)試驗發(fā)現(xiàn),此前的研究結(jié)果是正確的,即利用CRISPR/Cas9切割核小體或許會降低其作用效率。

DNA鏈雖然很小,但如果其拉伸的話大概有六英尺長,正因為如此,細胞就擁有了如何將DNA包裝到細胞核中的特殊機制,這一機制包括將DNA鏈纏繞在特定的蛋白質(zhì)上,而諸如卷成的束狀結(jié)構(gòu)稱之為核小體,邏輯表明,編輯DNA鏈的技術(shù)可能會因為可獲取性的問題而遇到困難。其他研究人員也考慮到了這種問題的可能性,但他們在試管中研究過,或者在非核小體的已知鏈上做過相關(guān)的研究,這項研究中,研究人員就想通過研究來闡明CRISPR/Cas9在編輯核小體部分鏈上是否像編輯其它DNA鏈那么有效。

文章中,研究人員利用CRISPR/Cas9技術(shù)對活酵母中不同的導(dǎo)向RNAs進行編輯,這就能夠?qū)崿F(xiàn)對不同靶點的編輯。研究者表示,相比非核小體的區(qū)域而言,當(dāng)對核小體區(qū)域進行編輯時,CRISPR/Cas9的編輯效率會發(fā)生降低;當(dāng)研究人員對諸如鋅指等基因編輯技術(shù)進行監(jiān)測時,他們并未發(fā)現(xiàn)任何差異,后期研究人員或?qū)⑦M行更為深入的研究來改善CRISPR/Cas9對核小體區(qū)域進行基因編輯的效率。

原始出處:Robert M. Yarrington, Surbhi Verma, Shaina Schwartz, et al. Nucleosomes inhibit target cleavage by CRISPR-Cas9 in vivo, Proceedings of the National Academy of Sciences (2018). DOI:10.1073/pnas.1810062115

原標題:PNAS:核小體或會抑制“基因魔剪”CRISPR-Cas9的切割效率

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