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科學(xué)家鑒別出能有效預(yù)測皮膚癌風(fēng)險的“超級熱點區(qū)域”

來源:生物谷   2019年12月04日 13:37 手機(jī)看

最近,一項刊登在國際雜志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究報告中,來自耶魯大學(xué)的科學(xué)家們通過研究在人類基因中發(fā)現(xiàn)了“超級熱點區(qū)域”(hyperhotspots),相比基因組平均水平而言,這些位點對來自太陽光紫外線輻射的敏感程度是前者的170倍。暴露于紫外線輻射中往往是引發(fā)皮膚癌的主要原因,而對這些超級熱點區(qū)域進(jìn)行篩選或許能幫助有效預(yù)測個體患皮膚癌的風(fēng)險。

研究者對熱點區(qū)域非常熟悉,但對超敏感熱點區(qū)域(ultra-sensitive hotspots)卻并不熟悉;研究者Douglas Brash說道,基因組中這些位點的敏感性是其它位點的100倍,名為“環(huán)丁烷嘧啶二聚體超熱點”(cyclobutane pyrimidine dimer (CPD) hyperhotspots)就是根據(jù)紫外線所誘發(fā)的DNA損傷類型而進(jìn)行命名的,其被認(rèn)為是能吸引破壞性輻射的“靶心”熱點區(qū)域。這項研究中,研究者發(fā)現(xiàn),這種情況通常發(fā)生于黑色素細(xì)胞(melanocytes)中。

研究者表示,我們認(rèn)為,引發(fā)癌癥的DNA損傷和突變發(fā)生往往是罕見事件,但研究表明,至少在皮膚癌中,基因組中就存在一些特殊靶點能被紫外線輻射所“擊中”。隨后研究者設(shè)計了一種方法來標(biāo)記CPDs位點,并利用高通量DNA測序技術(shù)來對基因組中的標(biāo)記進(jìn)行圖譜繪制,隨后他們開發(fā)出了一組統(tǒng)計學(xué)方法來對與平均基因組相關(guān)的CPDs過量表達(dá)的位點進(jìn)行定量分析。

研究者指出,這些熱點區(qū)域位于基因附近,其能作為紫外線輻射直接損傷細(xì)胞的直接通路,研究者所鑒別出的超級熱點區(qū)域位點是一組相同的DNA序列,其能控制DNA轉(zhuǎn)化成為RNA和蛋白質(zhì)(細(xì)胞調(diào)節(jié)生長的方式)。在紫外線輻射的曬傷程度下,機(jī)體皮膚黑色素細(xì)胞中的超級熱點區(qū)域常常會被紫外線輻射所影響,一個人會實時不斷地經(jīng)歷由紫外線輻射所引起的特殊細(xì)胞生長的扭曲過程,這并不像之前認(rèn)為的是隨機(jī)的或不可預(yù)測的。

那么為何機(jī)體進(jìn)化不希望擺脫這些問題呢?實際上,進(jìn)化并不會消除這些靶心,這或許就是一種暗示,即細(xì)胞能利用超級熱點區(qū)域來感知環(huán)境;超級熱點區(qū)域的存在表明,由致癌物紫外線輻射等所引發(fā)的突變或許并不是完全隨機(jī)的,黑色素瘤中與基因調(diào)節(jié)相關(guān)的突變或許在CPD超級熱點區(qū)域中出現(xiàn)的頻率是其它地方的2萬倍。

如今研究人員開發(fā)了一種新方法來推測人群患皮膚癌的風(fēng)險,評估疾病風(fēng)險的重要因素就是個體此前紫外線的暴露情況,目前臨床醫(yī)生缺乏一種客觀的測定方法,通常依賴于患者對以前曬傷的記憶,如果醫(yī)生們能對來自患者機(jī)體一小塊皮膚進(jìn)行超級熱點區(qū)域的檢測,他們就能獲取這些位點此前曬傷所造成的DNA損傷的真實圖像,從而就能更好地理解患者的暴露史及患皮膚癌的風(fēng)險。因此,皮膚科醫(yī)生應(yīng)該密切關(guān)注高危人群,以便能夠盡可能早地診斷并治療皮膚癌患者。

原始出處:

Sanjay Premi, Lynn Han, Sameet Mehta, et al. Genomic sites hypersensitive to ultraviolet radiation, Proceedings of the National Academy of Sciences (2019). DOI: 10.1073/pnas.1907860116

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